Ved havet er bredden af dalen ikke mere end 150 meter, her er også Guds Moder kirke, tilsyneladende bygget på stedet for et gammelt tempel. I 1957/1958 blev de første udgravninger udført af arkæologforeningen West Crete. Værdifulde rester af bygninger og genstande blev opdaget, som blandt mange andre spor antyder eksistensen af et tempel for guden Asclepius. I 1957 kom et lille, smukt tempel Asklepios ved et uheld.
Den internationalt anerkendte arkæolog Nikolaos Platonas rapporterer, at der i Lissos er resterne af en polygonal mur, dele af bygninger, rester af termiske bade, ruiner af granitkapeller, et lille teater fra den græsk-romerske periode, bade til behandling af de syge. Pisterne omkring den lille dal Agios Kirkos er fulde af grave, der ikke er skåret ud i klippen, men hver grav er en lille bygning.
Indgangene til disse grave, som ofte endda har to etager, er så små, at kun en (ikke for overvægtig) person kan passe. Mange af disse grave er pudset med mørtel på indersiden og i meget god stand - disse grave betragtes som de mest imponerende på øen.
Lissos storhedstid var sandsynligvis omkring 40 f.Kr. til Romerriget. Der var et lille tempel i dorisk stil bygget på store, udskårne sten. Udgravningerne fandt et stort antal store og små ofrebilleder, der repræsenterede guden Asklepios, gudinden "Ygia" og Pluton. De fleste blev fundet hovedløse; deres produktion går tilbage til slutningen af de hellenistiske og græsk-romerske epoker. De fleste figurer er klassiske.
Dele af Asklepios tempel er stadig der, og de runde buer er tilbage. Lidt videre var der et vandsystem, der var forbundet til kilden til helligdommen. Desuden blev der fundet mange mindre guldgenstande, der vidner om rigdommen i denne lille by, og som nu kan beundres på de arkæologiske museer i Chania og Heraklion.
Lissos var også berømt for vandet fra de lokale helbredende kilder og er blevet et stort vandsanatorium med besøgende fra hele Kreta og endda fra Afrikas nordkyst. Byen har altid opretholdt gode forbindelser med andre byer i den vestlige del af Kreta, såsom Yrtakina, Siia, Eliros eller endda Kalamadi, måske endda tjent som en havn i Yrtakina.
Turen fra Paleochora tager cirka 3,5 timer, fra Sougia 1,5 timer. Tag nok vand med dig.
Det ser ud til, at kun alle de gamle byer blev myntet i Lissos. Mønterne viste havsymboler, hjelme, Dioscuri-stjerner, bue og dirrer.