Den Gamle By: Heraklion voksede omkring havet og stadig dirigerer den gamle bydel på havnen, med det mest bemærkelsesværdige monument Koules, en imponerende 16. århundrede fæstning bygget af venetianerne. Du kan klatre på vældene for en smuk udsigt. Herfra kan du se arsenalerne, udbredte buer med hvælvede rum, hvor venetianerne har repareret deres skibe og den travle promenade ved kysten, foret med fisk og skaldyrsrestauranter. Den gamle bydel er beskyttet af et kredsløb af massive forsvarsmure, som delvist nedrives. Indenfor er de bilfri gader afgrænset af aristokratiske bygninger, kirker og butikker, der åbner op på en grønne plads med springvand og travle caféer.
Knossos slot: Det største og bedst bevarede minoiske område Kreta ligger fem kilometer sydøst for Heraklion, som er let tilgængeligt med lokal bus. Et stort monumentalt palads, med fire vinger bygget omkring en rummelig gårdhave, antages det, at Knossos var den mytiske labyrint af King Minos. Bemærkelsesværdigt raffineret, det omfattede ceremonielle rum, opholdsrum, opbevaringsrum, omfattende dekoration og et komplekst dræningssystem. Selv udgravninger viser, at der havde været et palads for Kristus i 2000, hvad du ser i dag, er hovedsageligt fra 1450 f.Kr., med en noget fantasifuld rekonstruktion af det tidlige 20. århundrede og mange kopier af kalkmalerier (originalerne er i arkæologi Museum of Heraklion).
Det arkeologiske museum i Heraklion: smukke 3,500 år gamle fresker af Knossos, kan ses i dette museum. Mens hovedbygningen af museet er lukket for renovering siden 2006, se denne fremragende midlertidig udstilling af omkring 450 gamle fund af øen stadig se kronologisk arrangeret med forklarende tekster i både græsk og engelsk. Dette verdensklasse museum er den vigtigste turistattraktion i Heraklion og ligger i den østlige del af den gamle by.
Kretas historiske museum: med en række udenlandske besætningsmedlemmer er Kretas historie kompliceret, men fascinerende. Dette museum har 1700 års historie på øen, fra tidlig kristen tid til moderne tid. Du ser religiøse ikoner, stenskulpturer, keramik, tekstiler og kostumer fra den byzantinske, venetianske og tyrkiske perioder samt en dyster rum dedikeret til den kretensiske modstandsbevægelse og dem, der døde under Anden Verdenskrig. Museet ligger i et restaureret palæ, 10 minutters gang vest for den gamle havn.
Cretaquarium Thalassocosm: I dette store moderne akvarium kan du opleve Middelhavets undervands liv. En fascinerende dag ud for børn og voksne, det har 32 enorme glas tanke med alt fra hajer til små søheste, vandmænd, havskildpadder, hummere og blæksprutte, alle i smukt oplyst turkisblåt hav på baggrund af sten, sand og tang. Du kan finde akvariet på en tidligere amerikansk militærbase i Gournes, 13 kilometer øst for Heraklion.
El Greco Museum, Fodele: I det 16. århundrede var Heraklion hjemsted for en vigtig skole af religiøse ikon malere. Et af hans medlemmer, Domenikos Theotokopoulos (1541-1614), blev senere en verdensklasse kunstner, bedre kendt som El Greco. Han blev født i den enkle landsby Fodele, midt i appelsinlunde 28 kilometer vest for Heraklion. I dag er stenhuset, hvor han blev født, et museum. Theotokopoulos flyttede til Spanien i 1577 og boede og arbejdede der indtil hans død. Hans malerier er kendt for deres intense farver og drama, du kan se flere gengivelser af hans værker her.